Useissa etyyliestereillä tehdyissä eläinkokeissa on nähty myrkyllisen etanolin vapautuminen maksaan ja haimaan, mikä voi aiheuttaa sisäelinvaurioita.
Vaikka luonnollisissa kalaöljyissä on joissakin tapauksissa puolet etyyliesteröidyn kalaöljyn omega-3-pitoisuudesta, ne kuitenkin imeytyvät kehoon 2-3 kertaa paremmin. Siksi luonnolliset kalaöljyt ovat edelleen omega-3-lisien huipulla