Après cette victoire le territoire de Lyons perdit sa position stratégique et donc un peu de son prestige militaire et social, même si le roi de France le garda comme lieu de villégiature et de chasse.

la petite ville de Lyons gagner en importance avec au XVIe siècle l’établissement d’un bailliage secondaire et un siège d’élection lui conférant une certaine indépendance par rapport à Gisors

L’unité territoriale, héritage des lois romaines, puis des ducs de Normandie et des rois de France, avait implosé en faveur d’un remembrement en plusieurs départements : Seine-Inférieure et Eure. Le Pays de Lyons vécut difficilement cet écartèlement de son territoire et le désormais chef-lieu de canton perdit en importance en devenant simplement un gros bourg rural. Il n’y eut pas seulement l’organisation juridique et politique qui fit défaut d’un coup à Lyons mais aussi la disparition des abbayes médiévales et des couvents d’Ancien Régime, devenus eux aussi biens nationaux et livrés à des tâches nouvelles.

Les tentatives d’industrialisation (filatures principalement, verrerie aussi) n’eurent qu’un succès de courte durée, comme la reconversion de l’ancien couvent de Cordeliers de Lyons-la-Forêt en manufacture de toiles imprimées par Louis Goutan qui cessa son activité en 1848.